FunMap memiliki relevansi fungsional yang tinggi, cakupan proteome yang dalam, dan topologi jaringan modular tanpa skala. Kredit: Kanker Alam (2024). DOI: 10.1038/s43018-024-00869-z
Pembuatan profil protein dan gen yang ekstensif telah memperluas cakupan protein dan mutasi gen yang terkait dengan kanker, namun sulit untuk membedakan apakah protein dan mutasi gen tersebut berperan aktif dalam penyakit ini atau hanya sekedar pengamat saja.
Dalam sebuah penelitian yang diterbitkan di Nature Most cancers, para peneliti Baylor Faculty of Medication menemukan pendekatan berbasis pembelajaran mesin yang kuat dan tidak memihak yang disebut FunMap untuk menilai peran mutasi terkait kanker dan protein yang belum dipelajari, dengan implikasi luas untuk memajukan biologi kanker dan menginformasikan strategi terapi. .
“Memperoleh informasi fungsional tentang gen dan protein yang berhubungan dengan kanker merupakan langkah penting menuju pemahaman yang lebih baik tentang penyakit ini dan mengidentifikasi target terapi potensial,” kata penulis terkait, Dr. Bing Zhang, Profesor Genetika Molekuler dan Manusia Lester dan Sue Smith. Pusat Payudara Baylor.
“Pendekatan kami untuk mendapatkan wawasan fungsional terhadap gen dan protein ini melibatkan penggunaan pembelajaran mesin untuk mengembangkan jaringan yang memetakan hubungan fungsional mereka,” kata Zhang, anggota Pusat Kanker Komprehensif Dan L Duncan Baylor dan McNair Scholar.
“Sepertinya, saya mungkin tidak tahu apa-apa tentang Anda, tapi jika saya tahu koneksi Anda di LinkedIn, saya bisa tahu apa yang Anda lakukan.”
Tim tersebut mengembangkan FunMap, jaringan fungsional 10.525 gen yang dibangun menggunakan metode pembelajaran mesin yang diawasi yang mengintegrasikan kumpulan knowledge protein dan knowledge pengurutan RNA dari 11 jenis kanker yang baru-baru ini diselaraskan oleh Konsorsium Analisis Proteomik Tumor Klinis Pan-Kanker (CPTAC).
“Dengan FunMap, kami menemukan 196.800 hubungan di antara 10.525 protein—cakupan proteomik yang komprehensif dan tidak memihak serta relevansi fungsional tingkat tinggi,” kata Zhang.
“Dua perbedaan utama antara pendekatan kami dan studi jaringan koekspresi gen sebelumnya adalah yang pertama, integrasi data protein kanker dengan data ekspresi mRNA dan kedua, penerapan pembelajaran mesin yang diawasi untuk mensinergikan semua kumpulan data guna memaksimalkan kekuatan prediksi.” Tanpa diduga, pendekatan kami mengungguli jaringan interaksi protein-protein dalam membedakan antara pasangan gen yang relevan secara fungsional dan tidak relevan.”
Melalui analisis jaringan, FunMap mengungkap modul protein dan organisasi modular hierarkis yang terkait dengan ciri khas kanker dan fitur klinis, memprediksi fungsi protein kanker yang belum dipelajari, menawarkan wawasan lebih dalam mengenai pemicu kanker yang sudah ada, dan mengidentifikasi pemicu dengan frekuensi mutasi rendah.
“Lebih dari 200 gen diekspresikan secara berlebihan atau kurang pada kanker, namun kita hanya mengetahui sedikit tentang peran spesifiknya dalam penyakit ini,” kata Zhang. “Saat kami memetakan gen-gen ini di jaringan kami, kami dapat melihat lingkungan sekitar dan memprediksi fungsinya.”
Misalnya, ekspresi gen MAB21L4 yang belum diteliti secara signifikan di bawah regular pada tiga jenis tumor kanker. FunMap menunjukkan bahwa lingkungan jaringan gen ini diperkaya dengan gen yang terkait dengan diferensiasi sel epitel, yang penekanannya memainkan peran kunci dalam perkembangan tumor.
Information penilaian tumor klinis, bersama dengan penelitian terbaru yang menunjukkan bahwa hilangnya MAB21L4 menghambat diferensiasi untuk mendorong perkembangan karsinoma sel skuamosa, memberikan bukti kuat yang mendukung peran penekan tumor untuk MAB21L4.
Selain itu, penggunaan metode pembelajaran mendalam yang canggih dengan FunMap mengungkap sejumlah pemicu kanker yang sebelumnya tidak dikenal dengan frekuensi mutasi rendah, termasuk peran penekan tumor baru untuk LGI3, yang didukung oleh knowledge knockout gen eksperimental.
Studi ini menyoroti potensi besar dalam mengintegrasikan pembelajaran mesin dan profil proteogenomik untuk mendapatkan pemahaman lebih dalam tentang sistem kanker yang kompleks. Dengan menghasilkan jaringan fungsional yang komprehensif, pendekatan ini memberikan kerangka kerja yang kuat untuk penelitian genomik fungsional kanker, menawarkan wawasan berharga mengenai mutasi dan protein terkait kanker.
“Temuan ini dapat sangat membantu memprioritaskan target untuk terjemahan klinis, yang pada akhirnya berkontribusi pada pengembangan terapi kanker yang lebih efektif,” kata Zhang.
Informasi lebih lanjut: Pemetaan jaringan fungsional kanker manusia melalui pembelajaran mesin dan proteogenomik pan-kanker, Nature Most cancers (2024). DOI: 10.1038/s43018-024-00869-z. www.nature.com/articles/s43018-024-00869-z
Paket FunMap Python sepenuhnya open supply dan tersedia untuk diunduh dari indeks paket Python.
Disediakan oleh Fakultas Kedokteran Baylor
Kutipan: Pembelajaran mesin mengungkap jaringan fungsional gen dan protein pada kanker manusia (2024, 11 Desember) Diakses pada 11 Desember 2024, dari https://medicalkpress.com/nevs/2024-12-machine-reveals-function-netvork-genes . html
Dokumen ini memiliki hak cipta. Kecuali untuk transaksi wajar untuk tujuan studi atau penelitian pribadi, tidak ada bagian yang boleh direproduksi tanpa izin tertulis. Konten disediakan untuk tujuan informasi saja.
solusi praktis menikah
solusi praktis
praktek solusi
Informasi mengenai KING SLOT, Segera Daftar Bersama king selot terbaik dan terpercaya no satu di Indonesia. Boleh mendaftar melalui sini king slot serta memberikan hasil kembali yang paling tinggi saat sekarang ini hanyalah king slot paling gacor, gilak dan gaco saat sekarang di Indonesia melalui program return tinggi di kingselot serta pg king slot
jablay88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://jablay88.biz/
jadijp88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://jadijp88.com/
jazz88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://jazz88.biz/
jurutogel88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://jurutogel88.web/
kangbet88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kangbet88.biz/
kilau88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kilau88.asia/
kuningtoto88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kuningtoto88.web/
lomboktoto88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://lomboktoto88.org/
mager88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://mager88.biz/
mantul888 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://mantul888.biz/
mawartoto88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://mawartoto88.asia/
meriah88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://meriah88.biz/
moba88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://moba88.org/
paristogel88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://paristogel88.biz/
parsel88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://parsel88.web/
paus13 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://paus13.com/
pay7777 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://pay7777.web/
planetliga88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://planetliga88.web/
ratuslot88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://ratuslot88.biz/
rtp100 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://rtp100.web/
ruby88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://ruby88.org/
rungkad88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://rungkad88.biz/
senopati88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://senopati88.biz/
sis88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://sis88.biz/
sistoto permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://sistoto.web/
sontogel88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://sontogel88.com/
spin98 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://spin98.biz/
totosaja88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://totosaja88.com/
warung22 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://warung22.com/
warung88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://warung88.asia/
winrate999 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://winrate999.biz/
wuzz888 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://wuzz888.com/
999jitu permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://999jitu.org/
adu88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://adu88.asia/
basket88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://basket88.web/
batu88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://batu88.biz/
berita88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://berita88.biz/
bukalapak88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://bukalapak88.web/
cipit888 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://cipit888.asia/
delta888 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://delta888.biz/
dosen88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://dosen88.org/
jago17 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://jago17.com/
jalantoto88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://jalantoto88.biz/
janjigacor88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://janjigacor88.org/
jitujp88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://jitujp88.com/
jokiwin88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://jokiwin88.web/
juragan66 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://juragan66.biz/
kenzototo88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kenzototo88.biz/
kkslot77slot permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kkslot77slot.com/
kompas88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kompas88.biz/
kopi88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kopi88.biz/
kudajitu88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kudajitu88.biz/
kursi88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kursi88.biz/
liputan88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://liputan88.web/
livitoto88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://livitoto88.web/
lotus88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://lotus88.asia/
m77casino88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://m77casino88.com/
majujp88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://majujp88.org/
mamikos permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://mamikos.org/
mamikos88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://mamikos88.com/
masterplay88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://masterplay88.asia/
masterplay999 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://masterplay999.web/
medantoto88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://medantoto88.biz/
medusa888 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://medusa888.com/
meja88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://meja88.biz/
midasplay88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://midasplay88.biz/
mijit888 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://mijit888.web/
mposun88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://mposun88.web/
ibisbudget88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://ibisbudget88.com/
mercure88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://mercure88.com/
hotel88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://hotel88.web/
sheraton88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://sheraton88.com/
ubud88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://ubud88.asia/
hardrock88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://hardrock88.com/
kuta88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kuta88.asia/
nasigoreng88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://nasigoreng88.com/
sate88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://sate88.com/
rendang88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://rendang88.asia/
gadogado permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://gadogado.org/
kfc88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kfc88.web/
pizzahut88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://pizzahut88.web/
starbucks88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://starbucks88.stay/
sederhana permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://sederhana.org/
kopikenangan permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kopikenangan.asia/
angkawin permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://angkawin.web/
rockygerung88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://rockygerung88.com/
monopoli88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://monopoli88.com/
kimjongun permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kimjongun.asia/
catur88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://catur88.asia/
tato88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://tato88.org/
speaker88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://speaker88.web/
rajah permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://rajah.asia/
kunci gitar permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kuncigitar.org/
gitar88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://gitar88.asia/
gambartato permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://gambartato.com/
gambar88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://gambar88.org/
maxwin888slot permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://maxwin888slot.com/
rumah permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://rumah.asia/
nada888 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://nada888.information/
musik88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://musik88.asia/
sewarumah permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://sewarumah.biz/
slot demo gacor permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kdwapp.com/
akun demo slot gacor permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kdwapp.com/
akun slot demo gacor permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kdwapp.com/
akun demo slot pragmatic permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kdwapp.com/
akun slot demo pragmatic permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kdwapp.com/
akun slot demo permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kdwapp.com/
akun demo slot permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kdwapp.com/
slot demo gacor
akun demo slot gacor
akun slot demo gacor
akun demo slot pragmatic
akun slot demo pragmatic
akun slot demo
akun demo slot
slot demo gacor permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://jebswagstore.com
akun demo slot gacor permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://jebswagstore.com
akun slot demo gacor permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://jebswagstore.com
akun demo slot pragmatic permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://jebswagstore.com
akun slot demo pragmatic permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://jebswagstore.com
akun slot demo permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://jebswagstore.com
akun demo slot permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://jebswagstore.com
slot demo gacor
akun demo slot gacor
akun slot demo gacor
akun demo slot pragmatic
akun slot demo pragmatic
akun slot demo
akun demo slot
slot demo gacor permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://demoslotgacor.professional
akun demo slot gacor permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://demoslotgacor.professional
akun slot demo gacor permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://demoslotgacor.professional
akun demo slot pragmatic permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://demoslotgacor.professional
akun slot demo pragmatic permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://demoslotgacor.professional
akun slot demo permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://demoslotgacor.professional
akun demo slot permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://demoslotgacor.professional
slot demo gacor
akun demo slot gacor
akun slot demo gacor
akun demo slot pragmatic
akun slot demo pragmatic
akun slot demo
akun demo slot
slot demo gacor permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://situsslotterbaru.web
akun demo slot gacor permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://situsslotterbaru.web
akun slot demo gacor permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://situsslotterbaru.web
akun demo slot pragmatic permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://situsslotterbaru.web
akun slot demo pragmatic permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://situsslotterbaru.web
akun slot demo permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://situsslotterbaru.web
akun demo slot permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://situsslotterbaru.web
slot demo gacor
akun demo slot gacor
akun slot demo gacor
akun demo slot pragmatic
akun slot demo pragmatic
akun slot demo
akun demo slot
situs slot terbaru
slot terbaru
