Interpretasi biologis dari struktur information GRG. Kredit: Ilmu Komputasi Alam (2024). DOI: 10.1038/s43588-024-00739-9
Para peneliti genom dulunya dapat menyimpan kumpulan information mereka di laptop computer, namun dengan begitu banyak keseluruhan genom yang kini tersedia untuk dipelajari, kumpulan information berukuran besar yang dihasilkan harus disimpan di cloud – sehingga menghasilkan penghitungan yang lebih mahal, lebih lambat, dan rumit.
Sebuah metode baru yang dikembangkan di Cornell menyediakan alat dan metodologi untuk memampatkan ratusan terabyte information genom menjadi gigabyte, sehingga memungkinkan para peneliti untuk menyimpan kumpulan information di komputer lokal. Makalah mereka, “Memungkinkan analisis data tingkat biobank yang efisien dengan grafik representasi genotipe,” diterbitkan pada 5 Desember di jurnal Nature Computational Science.
“Bahkan beberapa tahun yang lalu, data yang kami pelajari biasanya bukan data pengurutan seluruh genom, yang berarti hanya sebagian kecil dari genom yang diukur, bukan keseluruhan genom.” Dan karena itu, information ukuran genom tidak begitu gila,” kata April Wei, asisten profesor biologi komputasi di Fakultas Seni dan Sains.
Ukuran information mentah sekarang dapat mencapai petabyte, kata rekan penulis Drew DeHaas, seorang pengembang genetika komputasi di Fakultas Pertanian dan Ilmu Hayati.
Wei selalu ingin mengembangkan metode untuk menggunakan information tingkat biobank untuk penelitian karena banyaknya informasi yang tersedia, namun banyak hal yang ingin dia lakukan tidak mungkin dilakukan karena biaya dan tantangan komputasi. Hal ini menginspirasinya, katanya, untuk mengatasi masalah kompresi yang berujung pada metode Genotype Illustration Graph (GRG), yang menggunakan grafik untuk mengelola information.
“Metode berbasis grafik telah lama digunakan dalam ilmu komputer dan bidang lainnya untuk memberikan kerangka kerja yang jelas dalam memecahkan masalah yang menantang,” kata DeHaas, namun sebelumnya GRG belum pernah diterapkan pada solusi kompresi information genomik skala Biobank.
Wei, yang terlatih sebagai ahli genetika populasi, sangat akrab dengan grafik yang digunakan dalam genetika populasi—walaupun GRG dirancang dengan cara yang berbeda.
“Tidak seperti representasi berbasis matriks konvensional, GRG merepresentasikan genotipe dalam bentuk grafik, di mana hubungan antar individu ditangkap melalui mutasi bersama dalam genom mereka. Struktur information GRG tidak hanya mengkodekan informasi genotipe secara lebih intuitif dan kompak, namun juga memfasilitasi perhitungan yang efisien berdasarkan pada grafik untuk tingkat lanjut analisis,” kata rekan penulis Ziqing Pan, seorang mahasiswa doktoral di bidang biologi komputasi.
GRG mengompresi information sambil berfokus pada skalabilitas dan merepresentasikan information dengan tepat, kata Wei.
“Keuntungan besar menggunakan grafik untuk kompresi adalah kita dapat melakukan penghitungan dengan grafik, tanpa harus mendekompresi data,” katanya. “Selain itu, algoritme spesifik dapat dikembangkan untuk melakukan hal-hal yang tidak dapat dilakukan manusia dengan format lama, sehingga ada potensi manfaat yang lebih besar.”
Karena GRG memungkinkan peneliti menganalisis information yang sama dengan lebih efisien, hal ini juga mengurangi biaya.
Informasi lebih lanjut: Drew DeHaas dkk, Memungkinkan analisis information yang efisien di tingkat biobank dengan grafik representasi genotipe, Nature Computational Science (2024). DOI: 10.1038/s43588-024-00739-9
Disediakan oleh Universitas Cornell
Kutipan: Metode Baru Mengompresi Terabites Knowledge Genomik menjadi Gigabyte (2024, 5 Desember) Diakses pada 5 Desember 2024, dari https://medicalkpress.com/nevs/2024-12-method-compresses-terabites-genomic-gigabites.html
Dokumen ini memiliki hak cipta. Kecuali untuk transaksi wajar untuk tujuan studi atau penelitian pribadi, tidak ada bagian yang boleh direproduksi tanpa izin tertulis. Konten disediakan untuk tujuan informasi saja.
solusi praktis menikah
solusi praktis
praktek solusi
Informasi mengenai KING SLOT, Segera Daftar Bersama king selot terbaik dan terpercaya no satu di Indonesia. Boleh mendaftar melalui sini king slot serta memberikan hasil kembali yang paling tinggi saat sekarang ini hanyalah king slot paling gacor, gilak dan gaco saat sekarang di Indonesia melalui program return tinggi di kingselot serta pg king slot
jablay88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://jablay88.biz/
jadijp88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://jadijp88.com/
jazz88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://jazz88.biz/
jurutogel88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://jurutogel88.internet/
kangbet88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kangbet88.biz/
kilau88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kilau88.asia/
kuningtoto88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kuningtoto88.internet/
lomboktoto88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://lomboktoto88.org/
mager88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://mager88.biz/
mantul888 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://mantul888.biz/
mawartoto88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://mawartoto88.asia/
meriah88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://meriah88.biz/
moba88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://moba88.org/
paristogel88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://paristogel88.biz/
parsel88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://parsel88.internet/
paus13 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://paus13.com/
pay7777 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://pay7777.internet/
planetliga88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://planetliga88.internet/
ratuslot88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://ratuslot88.biz/
rtp100 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://rtp100.internet/
ruby88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://ruby88.org/
rungkad88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://rungkad88.biz/
senopati88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://senopati88.biz/
sis88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://sis88.biz/
sistoto permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://sistoto.internet/
sontogel88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://sontogel88.com/
spin98 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://spin98.biz/
totosaja88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://totosaja88.com/
warung22 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://warung22.com/
warung88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://warung88.asia/
winrate999 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://winrate999.biz/
wuzz888 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://wuzz888.com/
999jitu permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://999jitu.org/
adu88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://adu88.asia/
basket88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://basket88.internet/
batu88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://batu88.biz/
berita88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://berita88.biz/
bukalapak88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://bukalapak88.internet/
cipit888 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://cipit888.asia/
delta888 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://delta888.biz/
dosen88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://dosen88.org/
jago17 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://jago17.com/
jalantoto88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://jalantoto88.biz/
janjigacor88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://janjigacor88.org/
jitujp88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://jitujp88.com/
jokiwin88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://jokiwin88.internet/
juragan66 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://juragan66.biz/
kenzototo88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kenzototo88.biz/
kkslot77slot permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kkslot77slot.com/
kompas88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kompas88.biz/
kopi88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kopi88.biz/
kudajitu88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kudajitu88.biz/
kursi88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kursi88.biz/
liputan88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://liputan88.internet/
livitoto88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://livitoto88.internet/
lotus88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://lotus88.asia/
m77casino88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://m77casino88.com/
majujp88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://majujp88.org/
mamikos permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://mamikos.org/
mamikos88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://mamikos88.com/
masterplay88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://masterplay88.asia/
masterplay999 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://masterplay999.internet/
medantoto88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://medantoto88.biz/
medusa888 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://medusa888.com/
meja88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://meja88.biz/
midasplay88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://midasplay88.biz/
mijit888 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://mijit888.internet/
mposun88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://mposun88.internet/
ibisbudget88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://ibisbudget88.com/
mercure88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://mercure88.com/
hotel88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://hotel88.internet/
sheraton88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://sheraton88.com/
ubud88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://ubud88.asia/
hardrock88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://hardrock88.com/
kuta88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kuta88.asia/
nasigoreng88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://nasigoreng88.com/
sate88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://sate88.com/
rendang88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://rendang88.asia/
gadogado permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://gadogado.org/
kfc88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kfc88.internet/
pizzahut88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://pizzahut88.internet/
starbucks88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://starbucks88.stay/
sederhana permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://sederhana.org/
kopikenangan permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kopikenangan.asia/
angkawin permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://angkawin.internet/
rockygerung88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://rockygerung88.com/
monopoli88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://monopoli88.com/
kimjongun permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kimjongun.asia/
catur88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://catur88.asia/
tato88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://tato88.org/
speaker88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://speaker88.internet/
rajah permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://rajah.asia/
kunci gitar permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kuncigitar.org/
gitar88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://gitar88.asia/
gambartato permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://gambartato.com/
gambar88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://gambar88.org/
maxwin888slot permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://maxwin888slot.com/
rumah permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://rumah.asia/
nada888 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://nada888.information/
musik88 permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://musik88.asia/
sewarumah permainan paling high dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://sewarumah.biz/
